Його визнано винним у скоєнні злочинів проти людства та засуджено до 8 років за участь у боротьбі проти збройних формувань націоналістів - Лісових братів - у 1953-54 р.р. Результати розслідування, проведеного естонськими спецслужбами, засвідчують, що Пенарт причетний до ліквідації двох озброєних партизанів особисто та вбивстві ще одного своїм підлеглим.

Як відомо Лісові брати чинили активний спротив окупаційному антинародному комуністичному режиму, що практикував фізичне та моральне винищення корінного населення.